Prezado Vitor,
Desde já agradecemos pelo seu contacto e a questão que coloca.
Por defeito a pesquisa de palavras mais frequentes contempla todos as fontes (documentos) que tenha no seu projeto, todavia poderá excluir as fontes nas quais não pretenda que seja feita a pesquisa. Para tal basta na pesquisa de palavras mais frequentes, na parte de edição da pesquisa, aceder a restrições e depois selecionar a opção excluir e de seguida selecionar as fontes internas que pretende excluir da pesquisa (ver link).
Esta solução funciona se as línguas diferentes estiverem em fontes diferentes. Caso tenha no mesmo documento as várias línguas não há como evitar que a pesquise contemple as várias línguas presentes nesse documento. A única forma seria posteriormente exportar o resultado da pesquisa para excel e depois lá apagar as células da língua que não pretende na pesquisa.
Esperamos que a solução proposta venha responder às suas necessidades.